مسطره بخش انتخاب و بازچاپ نفایس نسخ خطی است که آثار شاخص و گرانبهای تمدن اسلامی در آن به عرصه نمایش گذاشته می‌­شود. این مجموعه شامل مصاحف شریف، کتاب‌های مذهبی، ادبیات، علوم، طب و مرقعات و نگاره‌­ها می‌­باشد. با توجه به جایگاه و اهمیت برتر کتاب آسمانی قرآن در گام نخست در بخش گنجینه خوشنویسی متون مقدس اسلامی انتشار مصاحف شریف فراهم آمده است. وجود امکانات مدرن تصویربرداری و چاپ دیجیتال "آریاگرافیک" (متعلق به نشر سفیر اردهال) به بالا بردن کیفیت و سرعت در این بخش کمک شایانی می‌­نماید. به طور کلی، فعالیت متمرکز این بخش شامل: موضوعات نسخ خطی و نفایس تاریخی و هنری قرآن کریم، مجموعه‌‌های دوا و درمان در روزگاران کهن، منابع شاخص و شناخته شده طبابت در تمدن ایرانی و اسلامی، سفرنامه‌­ها و تذکره‌­های تاریخی، مجموعه‌­های رجال شناسی، مرقعات و تابلوهای هنری می‌باشد. آثار منتشره تاکنون :
جزء سی ­ام قرآن کریم، مصحف زرنگار نسخه خراسان (834 ه.ق)، جزء سوم قرآن به خط زین العابدین محمد کاتب شیرازی (888 ه.ق)، چند سوره قرآن به خط علیرضا عباسی (1012 ه.ق)، قرآن کامل به خط یاقوت مستعصمی (688 ه.ق)، جزء سی­ام قرآن به خط محمد الطبعی بن نعیم الدین شیرازی (1002 ه.ق)، مصحف شریف، به خط ابوالحسنعلی بن هلال ملقب به ابن بواب (391 ه.ق)، مصحف شریف دوره تیموری، نسخه موزه هنر والترز امریکا (950 ه.ق)، کتاب منافع الحیوان، ابن بختیشوع (888 ه.ق)، کتاب عجایب المخلوقات و غرائب الموجودات. زکریا بن ­محمد بن محمود القزوینی ( 888 ه.ق)، التفهیم للصناعه والتنجیم، ابوریحان بیرونی (888 ه.ق)، کتاب الادویه، عبدالرشید الطبیب (888 ه.ق)، کتاب الحیل، بنی موسی بن شاکر المنجم (888 ه.ق) و ... 

نفایس قرآنی

قرآن الفی
مصحف شریف زرنگار
قرآن روزبهان جزء سی ام
قرآن به خط ابن بواب بغدادی
قرآن به خط رضا عباسی
قرآن به خط کاتب شیرازی جزء سی ام
قرآن به خط یاقوت مستعصمی
قرآن کامل موزه هنر والترز